年轻男子谋杀案的调查出现转折，因为警方发现有个人与嫌疑人长得很像！

在刑警学院任职的物理天才唐川与中学教师石泓年少相识，因彼此对数学的共同兴趣而惺惺相惜，多年后唐川在调查一桩杀人案时，身为石泓邻居的陈婧被列入警方的“嫌疑人”之中，石泓与唐川因此再度重逢，而唐川却在调查中发现了更大的秘密……被迫站在对立面的唐川、石泓由此展开了一场高智商对决，一步步推动故事走向既震撼人心又令人扼腕的结局。

《金田一少年事件簿3》改编自著名同名漫画系列，是其真人系列剧的第三部。在旅行的列车上，青梅竹马美雪再次邂逅了金田一，并决定追随于他。金田一的祖父是大名鼎鼎的名侦探金田一耕助，而他本身是一位天才高中生侦探，用超过IQ180的头脑解开了各种充满难解之谜的杀人事件。平时是个充满热情的高中男生，事件发生后，会与青梅竹马七濑美雪、警视厅搜查一课的剑持警察一起，对难解事件追查探案。本片包括以下6个事件，分别为幽灵客船杀人事件、法兰西银币杀人事件、黑死蝶杀人事件、速水玲香诱拐杀人事件、魔术的森杀人事件和露西亚人形杀人事